石达开占领瑞金后，脱离太平天国已有一年有余，在这一年当中，石达开不仅没有在浙，闽一带打开局面，反而丢失了江西根据地。在清军的围追堵截下，石达开的部队分崩离析，人心思归，军队战斗力大不如前。
进入赣南后，石达开虽然暂时摆脱了清军重兵的追击，但此时江西抚州，建阳等地已被湘军张运兰，萧启江部控制，加上瘟疫横行，北进收复江西失地很不现实。在形势的逼迫下，石达开选择了清军力量相对薄弱的粤，桂地区作为下一步行动的战略目标。于是，在主要部队都转入赣南后，太平军开始有步骤地向粤，桂地区挺进。
石达开大军前队占领瑞金后，继续前进，逼近赣州府的会昌县城，12月2日，大队进抵会昌，开始攻城战斗，清军内外配合，击退太平军。次日，太平军再次攻打瑞金东，南两门，又被击退。
就在进攻会昌的同时，瑞金也遭到了团练的进攻，此时石达开已决定放弃瑞金，太平军后卫鏖战3小时后，迅速撤退，清军攻陷瑞金。
石达开见会昌久攻不下，便令部队绕过会昌，进攻会昌以西的安远县城。此时，从福建返回江西的林彩新，谭星等部花旗军也配合石达开大军，包围了赣州府西部的信丰县城。
围攻安远的太平军先以地雷轰塌安远小西门城垛数丈，但安远知县及营官率清军将太平军击退，抢筑城缺，太平军又在东门轰塌城垛，仍被清军用石块堵住。12月14日，太平军在大南门的地道挖成，用地雷轰塌城墙，接着派部队冲上缺口，正当清军与太平军厮杀时，小南门城墙又被轰塌，清军燃放大炮，仍不能阻止太平军进攻。后清军纷纷施放火器，方将太平军击退，清军急忙将两处城缺堵塞。
此后，太平军又在安远城东南角开挖两处地道，一至城根，一至城中，不料清军也由城内向外挖地道，这两处地道恰都与清军的地道挖通，正在地道中的太平军当即被杀，挖地道的方法也行不通。
12月25日，清军判断太平军已是疲惫不堪，当夜偷袭太平军营寨，纵火焚烧，太平军仓促迎战，伤亡巨大，此时，清军援军已赶到，太平军于是不再恋战，撤围而去。
12月26日，石达开分出一军进入南安府，进攻新城圩，自率大军进攻南安府城，年1月3日，太平军轰塌南安城墙，攻克南安府城。
花旗军围攻信丰，江西巡抚耆龄急忙派贵州威宁镇总兵遮课敦布率人前去救援，花旗军势大，清军多次加派援军，前后五次进攻围信丰的花旗军，而花旗军凭险踞守，清军难以骤解信丰之围。
太平军数万大军攻占南安，围攻信丰，使江西清朝当局深感威胁，赣南清军力量本来就弱，加上江西守军刘长佑不为瘟疫所袭，失去了战斗力，淸方在赣南对付石达开大军的除了遮克敦布一军外，只有当地的团练，战斗力极差，根本不是太平军的对手，这也是太平军一时可以喘息的机会。
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